Mikrovalovno sušenje, razvoj tehnologije sušenja po metodi konvektivnega sušenja, je bila verjetno prva uvedena metoda, ki ne zahteva neposrednega stika grelnega medija z vzorcem izdelka (Itaya in Mori, 2006). Mikrovalovi so opredeljeni kot elektromagnetni valovi v frekvenčnem pasu od približno 300 MHz do 300 GHz. Mikrovalovno sušenje je možno, ker so molekule vode, prisotne v mokrem materialu, električni dipoli. To pomeni, da imajo pozitiven naboj na enem koncu in negativen na drugi strani, zato se vrtijo, ko se poskušajo uskladiti z izmeničnim električnim poljem, ki ga povzroča magnetron. To molekularno gibanje ustvarja toploto s trenjem, ko se vrteče molekule udarijo v druge molekule in jih spravijo v gibanje (Sutar in Prasad, 2008). Med mikrovalovno sušenjem je temperatura posušenega materiala odvisna od ravnotežja med energijo, ki jo generirajo vodni dipoli v mikrovalovnem polju, in energijo, ki jo absorbirajo molekule vode, ki izhlapevajo s površine materiala (Figiel, 2010). Pri mikrovalovnem sušenju je glavna skrb vpliv različnih valovnih dolžin, vhodne moči in energijske učinkovitosti metode sušenja.
Danes je mikrovalovna tehnologija, kot so mikrovalovne pečice in pečice, običajen gospodinjski aparat, ki se uporablja za segrevanje hrane; vendar je zaradi gospodarskih in tehnoloških omejitev mikrovalovno sušenje še vedno omejeno v industrijskih aplikacijah. Pomanjkljivost sušenja v mikrovalovni pečici je, da zahteva elektriko, je drago in manj ekonomično kot druge metode. Poleg tega v primerjavi s konvektivnim vročim zrakom in SD mikrovalovno sušenje še vedno velja za relativno novo tehnologijo z veliko nerešenimi tehničnimi vprašanji. Zato so potrebne obsežne raziskave za izboljšanje tehnologije, preden se lahko široko uporablja v industrijskem obsegu (Sagar in Suresh Kumar, 2010). Izziv pri mikrovalovnem sušenju je izbira vhodne moči za uravnoteženje kakovosti izdelka in proizvodnih stroškov, povečanje prostornine lahko povzroči hiter prenos mase zaradi velike vhodne moči, izbira vhodne moči pa se razlikuje glede na lastnosti izdelka (Itaya in Mori, 2006).
Metode mikrovalovnega sušenja so navdušile raziskovalce, saj lahko mikrovalovne pečice prodrejo v vzorec v notranje plasti izdelka, kar bistveno izboljša kinetiko sušenja med upadanjem (McMiin, 2006). Selektivno segrevanje vode in organskih snovi prispeva k tej tehnologiji zaradi različnih polarnosti in brez izgub zaradi trenja med prenosom energije. Poleg tega sušenje v mikrovalovni pečici preprečuje lokalizirane vroče točke/ogrevanje v vzorcu, kar ima za posledico boljši fizični videz, teksturo in večje zadrževanje hranil, če je pravilno nastavljeno (Drouzas in Schubert, 1996). Če pa material ne spremeni svojega položaja v mikrovalovnem polju, lahko nehomogenost mikrovalovnega polja povzroči vroče točke v materialu. To lahko privede do zoglenitve med zadnjimi fazami sušenja (Wray in Ramaswamy, 2015). Zato je rešitev tega problema uporaba mikrovalovnega sušenja v kombinaciji s sistemom za vakuumsko sušenje. Ta kombinacija se je izkazala za učinkovito v številnih prejšnjih vrstah študij, ki so vključevale sušenje zelišč in sadja, da bi ohranile aktivne spojine in hkrati izboljšale kakovost končnega posušenega izdelka.
